在使用微生物下一代DNA测序对假肢关节进行吸收时评估污染风险:一个体外研究
Edward J McPherson1, Madhav Chowdhry, Devin R Young
1From the Departmenrt of Orthopaedic Surgery, David Geffen School of Medicine, UCLA, Los Angeles, CA (Dr. McPherson and Dr. Stavrakis); the Nuffield Department of Primary Care Health Sciences and Department of Continuing Education, Kellogg College, University of Oxford, Oxford, United Kingdom (Dr. Chowdhry); and the Oakland University William Beaumont School of Medicine, Rochester, MI (Mr. Young).
概括
用于检测关节感染中的微生物的下一代测序 (NGS) 在使用无菌技术时具有低的假阳性率,为0.8%. 环境空气中的污染是假阳性结果的可能来源.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 医学诊断 医学诊断 医学诊断
背景情况:
- 在周围假肢关节感染中检测微生物群是具有挑战性的.
- 微生物核糖体DNA的下一代测序 (NGS) 是一种潜在的诊断方法.
- 人们对NGS测试中虚假阳性结果存在担忧.
研究的目的:
- 在模拟的联合愿望中评估NGS测试的错误阳性率.
- 在吸入过程中识别潜在的污染源.
主要方法:
- 一项模拟的联合吸收研究使用50毫升瓶中的无菌盐水进行.
- 测试了四种不同的吸入技术,每种技术有20个复制.
- 吸入液体被转移到无菌真空箱中,分析污染点.
- 在NGS实验室直接测试了80个无菌盐水瓶的负控制组.
主要成果:
- 三种模拟技术的整体阳性检测率为0.8%.
- 第四种技术,涉及吸入10毫升的环境空气,显示了10%的阳性检测率.
- 负控瓶中的阳性检测率为1.2%.
结论:
- 通过使用无菌技术,NGS可以检测来自无菌盐酸吸收的DNA信号.
- 该研究发现,使用适当的无菌技术,假阳性率低至0.8%.
- 从被吸入针孔的环境空气中产生错误的微生物污染被认为是错误阳性的来源.
- 建议在每个流体转移点倡导针交换,以尽量减少污染.
