感染新型变异传染性病病毒感染的肉的综合转录基因组分析
Haifeng Xiong1, Jiayan Wu1, Shengnan Wang1
1Key Laboratory of Jiangsu Preventive Veterinary Medicine, Key Laboratory for Avian Preventive Medicine, Ministry of Education, College of Veterinary Medicine, Yangzhou University, Yangzhou, Jiangsu 225009, China; Jiangsu Co-Innovation Center for Prevention and Control of Important Animal, Infectious Diseases and Zoonoses, Yangzhou, Jiangsu 225009, China; Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety, The Ministry of Education of China, Yangzhou University, Yangzhou, Jiangsu 225009, China; Jiangsu Key Laboratory of Zoonosis, Yangzhou University, Yangzhou, Jiangsu 225009, China.
新型变种传染病病毒 (nVarIBDV) 导致的免疫抑制. 这项研究揭示了Fabricius的股票中的转录变化,包括免疫细胞疲劳和B细胞功能受损,影响家禽健康.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.
背景情况:
- 新型变种传染病病毒 (nVarIBDV) 是中国家禽行业经济损失的主要原因.
- nVarIBDV感染导致的亚临床但持续的免疫抑制.
- 在nVarIBDV感染期间,在Fabricius (BF) 股票中的综合性转录组变化和调节机制尚不清楚.
研究的目的:
- 为了阐明Fabricius (BF) 感染nVarIBDV后的肉囊中的全球转录组变化.
- 确定关键的调节机制,包括lncRNA和circRNA参与,是宿主反应的基础.
- 提供关于nVarIBDV对免疫力的免疫抑制作用的见解.
主要方法:
- 转录组测序 (RNA-seq) 在感染后7天和14天 (dpi) 在BF上进行.
- 分别表达的mRNAs,lncRNAs和circRNAs被确定并分析.
- 进行了功能性丰富分析,蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络和竞争性内源RNA (ceRNA) 网络分析.
- 用RT-qPCR验证了选择的差异表达基因 (DEGs) 的表达.
主要成果:
- 数以千计的差异表达的mRNAs,lncRNAs和circRNAs在7和14dpi时被确定.
- 丰富的途径包括免疫反应,NF-kappa B信号传递,T细胞激活和细胞外矩阵重塑.
- 关键基因与抗病毒反应,T细胞枯竭和纤维化相关的基因被突出显示.
- 与B细胞相关的基因 (例如BTK,RAG2,SYK) 的显著下调表明体免疫力受损.
- lncRNAs和circRNAs可能通过ceRNA机制调节关键通路 (Hippo,Ras,cAMP).
结论:
- nVarIBDV感染诱导了BF的复杂宿主反应,其特征是免疫激活,T细胞耗尽和B细胞枯竭.
- 这项研究提供了在nVarIBDV感染期间BF的第一个全面的转录组景观.
- 这些发现为nVarIBDV诱导的免疫抑制的分子机制和干预的潜在目标提供了关键的见解.
