探索改进的样本回收和加工方法,以植物基质的Bacillus anthracis子为目标
Michael Pirhalla1, Denise Aslett2, Worth Calfee3
1U.S. Environmental Protection Agency (EPA) Office of Air and Radiation/Office Radiation and Indoor Air, Radiation Protection Division (formerly: Office of Research and Development (ORD)/Center for Environmental Solutions and Emergency Response (CESER)/Homeland Security and Materials Management Division (HSMMD) at the time this manuscript was developed), Research Triangle Park, NC, USA.
优化Bacillus anthracis (Ba) 子从植被中恢复,包括减少样品动时间和测试各种治疗方法. 虽然一些方法可以提高地面垃圾和叶子的计数,但草样仍然具有挑战性.
科学领域:
- 环境科学 环境科学
- 微生物学 微生物学
- 分析化学 分析化学
背景情况:
- 环境污染的持续生物制剂,如 Bacillus anthracis (Ba) 需要有效的补救策略.
- 植被基质 (草,垃圾,叶子) 可能含有背景微生物,这些微生物会干扰污染评估期间的目标分析物回收.
- 标准化的样本采集和处理对于准确的环境监测至关重要.
研究的目的:
- 为了优化从植被样本中恢复代理Ba子.
- 研究将目标子与非目标化合物分离的方法.
- 探索减少植被样本中背景微生物干扰的技术.
主要方法:
- 缩短了用Tween 20® (PBST) 的酸盐缓冲盐水中的样本动时间,从2分钟减少到30秒.
- 评估了热,化学,抗真菌和酶治疗的组合,以缓解背景.
- 评估了传统的培养涂层和快速活性-聚合酶链反应 (RV-PCR) 用于子计数.
主要成果:
- 使用PBST的样品动时间显著减少到30秒.
- 没有单一的治疗方案可以完全消除草样本的背景干扰.
- 在使用特定处理 (例如,H2O2和热) 的地面垃圾和叶子样本中,成功列出了Ba代理子.
结论:
- 优化样本处理可以从某些植被矩阵中改善Ba替代体子的恢复.
- 由于持续存在的背景微生物,草样本在精确子计数方面存在独特的挑战.
- 需要进一步开发标准化的方法,以便可靠地对各种植被类型中的生物制剂进行环境监测.
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