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Updated: Jan 8, 2026

11:26
Sequencing of mRNA from Whole Blood using Nanopore Sequencing
Published on: June 3, 2019
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为产生原生和未经修改的细菌RNA进行纳米孔直接RNA测序和下游分析的协议
Zhihao Guo1, Yanwen Shao1, Lu Tan1
1Department of Infectious Diseases and Public Health, Jockey Club College of Veterinary Medicine and Life Sciences, City University of Hong Kong, Hong Kong, China.
STAR protocols
|December 19, 2025
概括
这项研究引入了使用纳米孔直接RNA测序 (DRS) 进行细菌RNA测序的新协议. 该方法使得本地细菌RNA的分析成为可能,克服了由于缺少多A尾带所带来的挑战.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 纳米孔直接RNA测序 (DRS) 通常需要用于适配器结合的多A尾.
- 细菌信使RNAs (mRNAs) 自然缺乏多分子A尾,这对DRS.是一个技术障碍.
- 现有的方法不足以通过纳米孔测序来分析本地细菌RNA的修饰.
研究的目的:
- 开发一种强大的协议,用于为纳米孔DRS.准备本地细菌RNA.
- 为了能够检测和分析细菌转录中的RNA修饰.
- 提供从样本准备到数据分析的全面工作流程.
主要方法:
- 从日志相Escherichia coli培养物中分离原生RNA.
- 在体外转录 (IVT) 细菌RNA的合成.
- 纳米层纳米孔直接RNA测序的适应.
- 开发下游生物信息管道,用于检测RNA修饰.
主要成果:
- 成功生成适合纳米孔DRS的原生和未经修改的细菌RNA.
- 证明该协议在检测RNA修饰方面的有效性.
- 为细菌RNA分析建立完整的工作流程.
结论:
- 本方案克服了使用纳米孔技术对细菌RNA进行测序的局限性.
- 这种方法促进了细菌RNA修饰及其功能影响的研究.
- 该协议为细菌转录组学研究提供了有价值的工具.

