从降解到破译:在降解条件下应用ATAC-seq对法医分子诊断
Yang Xu1, Ying Chen2, Zhuo Li3
1Department of Forensic Pathology and Forensic Clinical Medicine, West China School of Basic Medical Sciences and Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China; Department of Forensic Genetics, West China School of Basic Medical Sciences and Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China.
Forensic science international
|December 19, 2025
概括
用高通量测序 (ATAC-seq) 检测转化酶可访问性染色质可以检测受伤性脑损伤 (TBI) 在退化的人类脑组织中. 这种分子工具显示出对死后降解的强度,为法医科学提供了新的可能性.
科学领域:
- 法医科学 法医科学 法医科学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- DNA 退化挑战了当前的法医分子诊断.
- 以前的研究表明,在小鼠创伤性脑损伤 (TBI) 模型中,测试具有高通量测序 (ATAC-seq) 可行性的转化酶可访问性染色体.
- 对于人类法医样本中的ATAC-seq存在有限的评估,特别是在死后晚期降解下.
研究的目的:
- 系统地评估ATAC-seq在识别人体样本中TBI诱导的染色质可访问性变化的实用性.
- 评估ATAC-seq在人类大脑组织中的稳定性和可靠性,这些组织在死后退化的晚期阶段.
主要方法:
- 从人类TBI病例和对照组中收集了皮质大脑组织.
- 样品在死后0小时和24小时使用标准的ATAC-seq协议进行分析.
- 下游分析包括质量控制,差异性可访问性,途径丰富和转录因子动机分析.
主要成果:
- 所有样本都产生了高质量的测序数据.
- 在TBI和对照组之间确定了许多不同可访问的染色体区域.
- ATAC-seq证明了对24小时死后降解的稳定性,没有观察到任何显著差异.
结论:
- 创伤引起的染色质可访问性变化在退化的人类法医脑组织中是可检测和稳定的.
- ATAC-seq是一种可行的分子工具,用于在法医环境中分析人类死后脑样本.
- 在更大的法医病例系列中需要进一步验证.
