单细胞分析框架揭示了代谢亚种群作为生物生产异质性的驱动因素
Juline Savigny1, Kiyan Shabestary1, Maria Portela1
1Department of Bioengineering, Imperial College London, London, UK.
Nature communications
|December 21, 2025
概括
这项研究引入了一种单细胞生物传感器框架,用于分析微生物种群中的代谢异质性. 它揭示了环境变化 (如葡萄糖耗尽) 如何驱动具有独特生产能力的亚种群,从而使应变工程能够改善生物生产.
科学领域:
- 生物工艺工程 生物工艺工程
- 代谢工程是代谢工程.
- 合成生物学 合成生物学
背景情况:
- 微生物种群中的细胞异质性给生物工艺工程带来了挑战,影响了生物生产产量.
- 从技术上讲,量化单细胞代谢是很困难的,这阻碍了解决异质性的努力.
- 了解单细胞水平的代谢状态对于优化微生物细胞工厂至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证一个框架,使用生物传感器分析对单细胞代谢状态进行可靠的表征.
- 在环境干扰下检测和分离微生物种群中的同质异质性.
- 调查代谢亚种群对生物生产能力的影响,并探索改善菌株的策略.
主要方法:
- 开发一个单细胞生物传感器分析框架.
- 通过急性和逐渐的葡萄糖消耗诱导细胞分化.
- 培养用于生产紫和甘的微生物菌株.
- 为调节亚种群动态而种植银河糖.
主要成果:
- 生物传感器框架成功地描述了单细胞代谢状态,并检测出同质异质性.
- 葡萄糖消耗诱导了具有不同生产能力的代谢上不同的亚种群.
- 较低的细胞内pH值亚群显示出增强的violacein积累,但降低了烯产量.
- 银河糖种植被确定为一种增强利科生产表型的方法.
结论:
- 单细胞生物传感器分析提供了一个强大的工具,用于剖析微生物群体中的代谢异质性.
- 环境干扰可以推动具有明显代谢和生产特征的亚种群的差异化.
- 定制培养策略,如银河糖养,可以调节亚种群动态,以优化特定化合物的生物生产.


