介质细胞干细胞衰老的可测量指标
D A Kalashnikova1, S E Romanov2, D A Maksimov3
1Junior Researcher, Laboratory of Epigenetics; Novosibirsk National Research State University, 1 Pirogova St., Novosibirsk, 630090, Russia; Junior Researcher, Laboratory of Genomics; Institute of Molecular and Cellular Biology of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, 8/2 Acad. Lavrentiev Avenue, Novosibirsk, 630090, Russia.
这项研究分析了不同衰老模型中人类介质干细胞中的细胞衰老标志物. 使用转录组数据和细胞形态学的预测模型显示了评估年龄和体外培养时间的潜力.
科学领域:
- 细胞和分子生物学 细胞和分子生物学
- 干细胞生物学 干细胞生物学
- 老年学是指老年学的学科.
背景情况:
- 细胞衰老是衰老的关键标志,影响组织功能.
- 人类介质干细胞 (hMSCs) 对再生医学至关重要,它们的衰老会影响治疗潜力.
- 了解衰老标志物和开发预测模型对于hMSC应用至关重要.
研究的目的:
- 在hMSCs的复制性,压力诱导和时间老化模型中分析细胞衰老标志物.
- 评估预测模型的可行性,以估计使用转录和形态学数据的年代和体外培养持续时间.
主要方法:
- 实时PCR用于基因表达动态和端粒长度.
- 来自不同年龄的捐赠者的hMSCs的高通量转录组测序.
- 用于细胞形态分析的机器学习算法和用于核形态的细分神经网络.
主要成果:
- 在老化模型中,CDKN1A,LMNB1和HMGB2基因动态一致.
- 在hMSC转录组中,捐赠者依赖的异质性使精确的预测建模复杂化.
- 端粒长度分析适用于评估复制性衰老动态.
- 一个神经网络模型成功检测出与衰老相关的核形态变化.
结论:
- 特定的基因表达模式和端粒长度变化可以表明hMSCs的衰老.
- 细胞形态学,特别是核变化,为老化和培养持续时间提供了宝贵的见解.
- 整合转录和形态学数据的预测模型对年龄和培养时间的评估充满希望,尽管存在捐赠者的异质性挑战.
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