通过使用固定指数的SNP优先级来增强火生殖特征的基因组选择

科学领域:

• 动物育种与遗传学
• 量化遗传学 量化遗传学
• 禽畜科学 禽畜科学 禽畜科学

背景情况:

• 基因组选择 (GS) 提高了繁殖价值的准确性,但在像火繁殖这样的低遗传性特征上显示了适度的收益.
• 土耳其的繁殖特征经常表现出非正常的表型分布,使准确的遗传评估变得复杂.

研究的目的:

• 为了提高土耳其生殖特征的基因组选择的准确性.
• 改善基因组关系矩阵质量,并使表型分布正常化.

主要方法:

• 利用固定指数 (F_ST) 来选择信息性的单核酸多态 (SNP),区分极端的表型群体.
• 应用了Box-Cox转换来规范生殖特征的表型分布.
• 使用BLUP,GBLUP和ssGBLUP模型分析了卵产率 (PEP),生育率 (FERT) 和化能力 (HOF).

主要成果:

• 具有F_ST优先级的SNP显著改善了遗传性估计,特别是在生育方面 (FERT).
• 优先考虑前10%的F_ST标记物,在GBLUP (0.15到0.29) 中,FERT遗传率增加了93%.
• 盒子-Cox转换在所有方法中始终增加了遗传性,F_ST90和转换的结合产生了最高的估计值.

结论:

• 基于F_ST的SNP优先级和Box-Cox转换有效地提高了火生殖特征的基因组选择精度.
• 这些方法有助于识别优秀火,这对于基因改进计划至关重要.
• 这项研究表明,在家禽中优化GS的强大策略,以挑战性特征.