与遗传性视网膜退行相关的变异的低人口透率
Kirill Zaslavsky1, Liyin Chen2, Chloe Park2
1Department of Ophthalmology and Vision Sciences, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada; Ocular Genomics Institute, Massachusetts Eye and Ear, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
遗传视网膜退化 (IRD) 基因型的人口透率低于预期. 这表明疾病表现需要遗传或环境因素,影响IRDs的遗传测试和治疗开发.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 眼科医生 眼科 眼科
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 遗传性视网膜退化 (IRDs) 是工作年龄成人失明的主要原因.
- IRD通常被认为是具有高透性的单一产物.
- 表型鉴定可能会高估IRD透率,并掩盖基因型-表型谱.
研究的目的:
- 量化IRD相关变异在人群层面的透率.
- 在大型生物库中确定IRD基因型的真实流行率.
- 评估遗传和环境因素对IRD表现的影响.
主要方法:
- 在我们所有人 (AoU) 生物库中选了317,964名参与者,以检测IRD变体.
- 策划了一个具有IRD兼容基因型的队列.
- 定义的嵌套国际疾病分类 (ICD) -9/10代码集通过疾病注释频率 (DAF) 估计透率.
- 使用来自英国生物库 (UKB) 的视网膜成像数据验证的结果.
主要成果:
- 在AoU队列中的DAF从9.4% (IRD) 到28.1% (查),与一般人口患病率相比显著丰富.
- UKB验证显示,共有变异的参与者中有16.1%-27.9%具有IRD特征.
- 人口统计,生活方式和并发症并不能预测透性.
- IRD基因型的人口透率明显低于假设,实际的基因型流行率为0.7%-2.1%.
结论:
- 与IRD相关的基因型比以前认为的更为普遍.
- 透率低于预期,表明疾病发展需要基因或环境修饰剂.
- 这些发现需要对基因测试策略进行重新评估,并为IRDs开发治疗方法.
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