全基因组测绘揭示了AtfA对Aspergillus nidulans的发育,新陈代谢和应激准备有广泛的监管影响

科学领域:

• 菌类学 菌类学是指菌类学.
• 分子生物学分子生物学
• 发展生物学 发展生物学

背景情况:

• 在真菌中无性分泌 (基生成) 是一个复杂的过程,需要代谢和应激反应之间的协调.
• 转录因子AtfA在Aspergillus nidulans中整合这些过程中的作用尚未完全理解.

研究的目的:

• 调查bZIP转录因子AtfA在Aspergillus nidulans中与代谢和调节网络集成基生成中的作用.
• 确定AtfA的全基因组目标,并了解无性发育期间的调节机制.

主要方法:

• 结合ChIP-seq和RNA-seq分析对野生类型,∆atfA和补充的Aspergillus nidulans菌株进行.
• 实验是在无压力和氧化压力 (门) 条件下进行的.
• 识别保存的AtfA结合动机和功能目标的映射.

主要成果:

• AtfA直接与参与MAPK信号传递,光依赖性分泌,抗氧化防御,eisosome生物发生和三糖/多醇生物合成的基因促进剂结合.
• AtfA结合在很大程度上独立于压力,表明具有先发制人的调节作用.
• AtfA主要作为转录激活剂起作用,调节对子完整性和休眠性至关重要的过程.

结论:

• 在无性繁殖过程中,AtfA充当主整合剂,同步真菌形态发展与代谢准备.
• AtfA的监管范围不仅仅是应激适应,还包括指挥子成熟和发芽的必不可少的代谢过程.