生物标志物发现研究设计与接收者-操作者特征相一致
Joakim Ekström1, Ivaylo Stoimenov1, Jim Åkerrén Ögren1
1Department of Immunology, Genetics and Pathology, Science for Life Laboratory, Uppsala University, SE-751 85 Uppsala, Sweden.
Computer methods and programs in biomedicine
|December 24, 2025
概括
这项研究提出了一项最佳实践指南,用于使用接收器-操作器特征 (ROC) 分析发现生物标志物. 该ROC框架有助于确定有效的临床生物标志物,改进目前的方法.
科学领域:
- 生物标志物发现发现
- 统计学方法论 统计学方法论
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 在统计方法上缺乏共识,阻碍了早期生物标志物发现.
- 接收器-操作员特征 (ROC) 分析是体外诊断 (IVD) 设备性能的一个标准.
- 在生物标志物发现中普遍存在的陷需要系统地识别和减轻.
研究的目的:
- 系统地识别和减轻生物标志物发现中的陷.
- 提出生物标志物发现的最佳实践指南.
- 为生物标志物开发建立基于ROC分析的框架.
主要方法:
- 制定了一个生物标志物发现协议,目标一致,采样采购和研究规模的确定.
- 使用的接收器-操作员特征 (ROC) 框架用于数据分析.
- 采用蒙特卡洛模拟来指导研究设计和样本分配,用蛋白质组数据说明.
主要成果:
- 证明了符合监管的管道,与预言医疗器械相比,产生了更好的效果.
- 在公共数据集上使用基于ROC的分析识别出具有统计意义的复合生物标志物.
- 在一个独立的数据集中验证了生物标志物的子集,并注意到与常见特征选择方法的有限重叠.
结论:
- 拟议的方法有助于将科学发现转化为监管机构批准的生物标志物测试.
- 这一框架增强了新发现的生物标志物的临床实用性.
- 该ROC分析框架为生物标志物验证提供了一个强大的方法.


