转录组分析揭示了Epinephelus cyanopodus在急性缺氧压力下肝脏组织中的生理反应
Qiaoyi Chen1, Yukun Huang1, Zhiya Yu1
1South China Biodiversity Research Center, College of Life Sciences, Guangzhou University, Guangzhou, Guangdong, China.
Frontiers in physiology
|December 25, 2025
概括
低氧压力显著改变了E. cyanopodus的生理反应,特别是在3-6小时之间. 这项研究确定了参与鱼类适应低溶氧 (DO) 的关键基因和途径,以获得水产养殖的见解.
科学领域:
- 水生物质毒理学研究
- 鱼类生理学 鱼类生理学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 溶解氧 (DO) 对水生生态系统和养鱼可持续性至关重要.
- 鱼在遭受低氧压力时表现出生理适应.
- 了解这些反应对于水产养殖发展和鱼类健康至关重要.
研究的目的:
- 为了评估E. cyanopodus对实验性低氧压力的生理反应.
- 确定关键的基因,途径和低氧暴露的持续时间,这些基因会引发显著的变化.
- 为开发水产养殖中低氧耐药育种策略提供见解.
主要方法:
- E. cyanopodus被暴露在1,3,6和9小时的诺莫克斯和低氧条件下.
- 进行肝脏RNA测序 (RNA-seq) 来识别差异表达基因 (DEG).
- 用KEGG丰富分析来识别所涉及的缺氧反应途径和生物过程.
主要成果:
- 在对照组和缺氧治疗组之间,确定了6152个差异表达基因 (DEG).
- 3-6小时的低氧暴露被确定为显著生理变化的关键时期.
- 关键的途径包括HIF-1信号传递,谷氨代谢和免疫/代谢酶表达.
结论:
- 3-6小时的低氧暴露期对于E. cyanopodus的生理适应至关重要.
- 在葡萄糖溶解,酸盐代谢,免疫反应和亡调节中的DEG调节了低氧适应.
- 这些发现为了解低氧压力和水产养殖的实际策略提供了理论框架.
