珠子:为3D纤维素血管生成试验提供交互式半自动化工作流程,使共同培养和方向性分析成为可能

科学领域:

• * 生物医学工程 * 生物医学工程
• * 细胞生物学 * 细胞生物学
• * * 量化成像技术的使用

背景情况:

• * 3D纤维素珠血管生成试验对于在体外研究内皮发芽至关重要.
• *现有的分析方法耗时,难以处理复杂的成像,阻碍了对共同文化和空间相互作用的定量分析.
• *需要标准化,高效的工具来分析复杂的实验设置中的血管生成.

研究的目的:

• * 开发一个半自动化,用户交互式的图像分析管道,名为基于珠子的内皮血管生成数据套件 (BEADS).
• *在3D纤维素血管生成试验中提供发芽,迁移和空间定向的标准化,定量,以珠子为中心的指标.
• * 为了实现先进的分析,包括共同种植的指定,最近邻居配对和芽的方向性.

主要方法:

• * 集成的自动珠子检测与手动校正精度.
• * 在多通道图像z-stack中使用芽和迁移细胞的指导注释.
• * 纳入了用于共同文化识别,近邻分析和循环统计数据的新功能.

主要成果:

• *与手动追踪相比,BEADS可减少手动分析时间约7倍.
• * 苗长度的准确性与手动地面准确性相比,得到了保留.
• * 在与共同培养的人类肺微血管内皮细胞 (HPMECs) 的试验中表现出性能.

结论:

• *BEADS提供了一个标准化,可扩展的微血管图像分析平台.
• * 该工具支持共同培养实验,空间内皮细胞相互作用指标和迁移细胞量化.
• * 这种半自动化工作流程通过将计算精度与生物见解相结合,增强了定量微血管研究.