多omics集成识别了多样化的转录和染色质可访问性概况在Monopterus albus生殖腺
Yangyang Li1, Yuanli Zhao2, Hongrui Luo2
1Department of Obstetrics and Gynecology, Center for Reproductive Medicine, the Fourth Affiliated Hospital of School of Medicine, and International School of Medicine, International Institutes of Medicine, Zhejiang University, Yiwu, 32200, China.
Scientific data
|December 27, 2025
概括
这项研究通过创建一个全面的多omics数据集来增强对沼泽 (Monopterus albus) 性别逆转的理解. 该资源有助于研究鱼的性腺发育和改善水产养殖实践.
科学领域:
- 水产养殖是水产养殖的一种方式.
- 基因组学就是基因组学.
- 发展生物学 发展生物学
背景情况:
- 沼泽鱼 (Monopterus albus) 对水产养殖至关重要,但自然的性别逆转导致卵产量低.
- 了解这种性别逆转的分子基础对于提高水产养殖产量至关重要.
- 目前的知识受到不完整的基因注释和缺乏多omics数据的限制.
研究的目的:
- 在Monopterus albus的性别逆转过程中全面描述转录组和表观组.
- 识别涉及性腺发育的新型基因,转录和调控元素.
- 为Monopterus albus.建立一个增强的注释框架.
主要方法:
- 在九个发育阶段进行集成的Iso-seq,RNA-seq和ATAC-seq分析.
- 对染色质可访问性和基因表达动态的分析.
- 与现有的NCBI注释进行比较分析.
主要成果:
- 鉴定了37,911个新型转录,包括16,900个新型基因和替代异型.
- 发现了2,174个具有动态可访问性转移的假定cis-regulatory元素.
- 对Monopterus albus.的显著改进和全面的转录注释的开发.
结论:
- 这一多omics数据集为研究鱼类性腺发育提供了必不可少的资源.
- 这些发现为 Monopterus albus 的性别逆转背后的分子机制提供了洞察力.
- 增强的注释框架将促进鱼类繁殖和水产养殖的未来研究.
