探索转录组学,蛋白组学和机器学习在HPV感染和心血管疾病中的作用

科学领域:

• 传染性疾病 传染性疾病
• 心脏病学 心脏病学
• 基因组学就是基因组学.
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 机器学习 机器学习

背景情况:

• 人类乳头瘤病毒 (HPV) 与各种癌症有关,包括宫癌.
• 新出现的证据表明,HPV显著增加了心血管疾病 (CVD) 的风险,例如冠状动脉疾病 (CAD).
• HPV 对心血管疾病的影响的确切机制,特别是从蛋白质组和转录组的角度来看,仍然不清楚.

研究的目的:

• 建立一个应用机器学习 (ML) 来调查HPV和心血管疾病之间的复杂关系的证据框架.
• 通过蛋白质组和转录组分析,进一步了解HPV对心血管疾病的影响.

主要方法:

• 利用机器学习 (ML) 来分析蛋白质组和转录组数据.
• 执行公共和内部策划的数据库的生物信息挖掘.
• 确定了参与HPV相关心血管病变发生的关键蛋白质.

主要成果:

• 扩展性心肌病 (DCM) 被确定为由HPV感染显著改变的心血管疾病,超出已知与动脉样硬化和CAD的联系.
• 阐明了新的胆固醇修饰机制,有助于HPV在心血管疾病中的作用.
• 通过下游ML分析确定了进一步调查的关键蛋白质.

结论:

• 通过ML增强对HPV诱导的心血管疾病机制的理解.
• 针对患者分层的目标ML模型的开发.
• 优化患者对HPV相关心血管疾病新型益生菌疗法的反应的潜力.