修改和验证参考实时RT-PCR方法,用于检测一种新的非洲马病病毒变体

科学领域:

• 兽医病毒学 兽医病毒学
• 分子诊断学 分子诊断
• 流行病学 流行病学

背景情况:

• 非洲马病 (AHS) 是一种由非洲马病病毒 (AHSV) 引起的高度传染性的马病.
• 在欧盟,AHS是一种必须报告的疾病,需要在检测到时进行强制控制和根除.
• 现有的参考实时逆转录PCR (rRT-PCR) 方法,Agüero 2008和Guthrie 2013,是世卫组织验证的,但未能检测到新的AHSV变种.

研究的目的:

• 开发和验证一种经过修改的rRT-PCR方法,能够检测新发现的AHSV变种.
• 确保所有AHSV菌株的持续诊断能力,包括新兴变种.

主要方法:

• 开发用于阿古埃罗rRT-PCR方法的修改后的原料和探针,包括退化位置以适应序列变化.
• 通过西班牙和英国的WOAH参考实验室验证修改后的Agüero方法.
• 对AHSV菌株,临床样本和模仿新型变异的合成RNA (AHSV-sRNA-RSA) 的多样化小组进行测试.

主要成果:

• 经过修改的Agüero rRT-PCR方法显示出良好的诊断性能.
• 经过修改的方法成功检测了来自南非共和国 (RSA) 的新型AHSV变种,而此前的参考方法错过了该变种.
• 对比分析证实了修改后的试验的增强检测能力.

结论:

• 修改后的Agüero rRT-PCR测定是一种可靠的工具,用于检测新的RSA AHSV变种.
• 这一进展对于及时的AHS诊断,控制和根除工作至关重要,特别是在不断变化的病毒菌株的情况下.