对NDM-5的基因组洞察力 - - 产生大肠杆菌ST648在黎巴嫩的人类和野生动物来源的分离物

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 大肠杆菌序列类型648 (ST648) 是一个全球传播的系谱,属于类组F.
• 这种血统越来越多地与抗菌素耐药性有关,构成严重的公共卫生威胁.

研究的目的:

• 执行两个携带大肠杆菌ST648菌株的blaNDM-5的全基因组测序和比较基因组分析.
• 从临床和环境来源调查大肠杆菌ST648的遗传相关性和特征.

主要方法:

• 两个大肠杆菌菌株的全基因组测序 (来自的ECsOL198和来自白血病患者的ECOL247).
• 对比基因组分析,包括抗微生物耐药性和病毒性基因分析.
• 全基因组多部位序列类型化 (wgMLST) 用于确定家族遗传关系.

主要成果:

• 这两种分离物属于类组F,血清型O9:H4,并携带IncFIA,IncFIB和IncFII等离子体.
• 共享的抗菌素耐药性概况包括blaNDM-5,blaTEM-1,blaCTX-M-15,blaOXA-1,以及对氨基糖化物,硫胺,四环素和诺基诺耐药性的基因.
• wgMLST揭示了一种与印度ST648分离物密切相关的独特亚类,表明全球克隆相关性有限,但有可能传播.

结论:

• 多抗药性大肠杆菌ST648菌株在临床和非临床环境中传播,由野生动物和人类患者的分离体证明.
• 这些发现强调了动物和人类之间几乎克隆的多药耐药性大肠杆菌ST648的传播潜力.
• 这突显了有关卡巴酶产生的Enterobacteriaceae的全球传播的重大公共卫生问题.