多重转录组分析揭示了HepG2细胞中选择的lncRNA-mRNA和circRNA-mRNA网络,这些细胞表达4型猪肝炎E病毒ORF3的基因型
Hanwei Jiao1, Chi Meng1, Lingjie Wang1
1The College of Veterinary Medicine, Southwest University, Chongqing 402460, China.
Veterinary sciences
|December 31, 2025
概括
猪肝炎E病毒 (HEV) 开放阅读框架3 (ORF3) 蛋白调节宿主细胞通路. 这项研究确定了参与天生的免疫力,ERK活性和生长因子传输的circRNAs和lncRNAs,预测了调节网络.
科学领域:
- * 病毒学 病毒学
- * 分子生物学 * 分子生物学
- * 生物信息学是一门学科.
背景情况:
- *猪肝炎E (SHE) 是一种由猪肝炎E病毒 (HEV) 引起的动物传播疾病.
- * HEV开放阅读框架3 (ORF3) 蛋白对病毒毒性至关重要,影响宿主细胞过程,如ERK通路调节,亡和免疫信号传递.
- *了解ORF3的作用是解读HEV感染机制的关键.
研究的目的:
- * 识别和描述宿主细胞中由HEV-4 ORF3调节的非编码RNA (lncRNA和circRNA).
- *阐明这些非编码RNA在宿主细胞通路中的功能性作用.
- * 预测涉及与HEV感染相关的circRNAs,miRNAs和lncRNAs的调节网络.
主要方法:
- * 腺病毒介导的HEV-4ORF3在HepG2细胞中的过度表达.
- * lncRNA,circRNA和转录组的高通量测序.
- * 生物信息分析包括集群和网络构建 (circRNA-miRNA, lncRNA-mRNA).
主要成果:
- * 在表达HEV-4ORF3.3的HepG2细胞中鉴定出24个差异表达的circRNA和4个lncRNA.
- *特征性circRNAs参与调节宿主细胞的先天免疫 (8),维持ERK活性 (18),抑制生长因子输送 (4),抑制免疫反应 (3).
- *预测的circRNA-miRNA和lncRNA-mRNA调节网络.
结论:
- *成功识别了关键的差异表达基因和参与宿主细胞对HEV-4 ORF3.3反应的非编码RNA.
- *预测的监管网络为了解HEV感染机制提供了基础.
- * 这项研究提供了对猪肝炎E病毒病原发生的分子机制的见解.
