来自cfDNA的染色质可访问性作为质瘤的新型分类生物标志物
Qiuyue Wu1, Jian Wu2, Fan Wang3
1Institute of Laboratory Medicine, Jinling Hospital, Affiliated Hospital of Medical School, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing, Jiangsu, China.
Frontiers in oncology
|December 31, 2025
概括
这项研究使用无细胞DNA (cfDNA) 来识别质瘤中的开放色素区域. 这些发现显示了cfDNA液体活检在检测和分类质瘤的潜力.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 质瘤的分类依赖于与临床结果相关的分子特征.
- 基于无细胞DNA (cfDNA) 的结质瘤液体活检是困难的,因为瘤的cfDNA水平较低.
研究的目的:
- 使用cfDNA识别质瘤中的开放色素状态.
- 为了证明cfDNA在质瘤检测和分类方面的潜力.
主要方法:
- 使用瘤组织研究质瘤染色质的可访问性.
- 从配对的脑脊液 (CSF) 和血样本中测序了cfDNA.
- 使用CSF和血中的cfDNA识别了可访问的色素区域.
主要成果:
- 72个开放的染色体区域使用CSF cfDNA.确定.
- 使用血cfDNA发现了16个不同可访问的染色质区域,与质瘤等级相关.
- 使用16个血cfDNA特征的分类器区分了低级和高级质瘤 (AUC=0.814训练,AUC=0.736测试).
结论:
- 定义了用于质瘤液体活检的新型染色质可访问性生物标志物.
- 证明了基于cfDNA的染色质可访问性在质瘤诊断中的潜在应用.
