通过高度定制的分子网络平台,通过有双重排毒效应的芳香糖的有针对性的发现
Wen-Chao Yu1, Yan-Lei Yu2, Bing-Cheng Dong2
1College of Pharmaceutical Science & Collaborative Innovation Center of Yangtze River Delta Region Green Pharmaceuticals, Zhejiang Key Laboratory of Green, Low-carbon, and Efficient Development of Marine Fishery Resources, Zhejiang University of Technology, Hangzhou 310014, China; Binjiang Institute of Artificial Intelligence, Zhejiang University of Technology, Hangzhou 310056, China.
Cell chemical biology
|December 31, 2025
概括
MSanalyst是一个新平台,拥有46个算法,可以从复杂的自然产品中改进代谢物发现. 它在Kutzneria viridogrisea中发现了新的kutznaposides,揭示了一条用于减轻氧化应激的menaquinone分流途径.
科学领域:
- 自然产品药物发现自然产品药物发现
- 代谢学和生物信息学
- 微生物的二次代谢.
背景情况:
- 天然产品对于识别新的药物线索至关重要.
- 非定位代谢与MS2光谱比较是一种常见的发现方法.
- 现有的方法需要提高对代谢物注释的准确性和分辨率.
研究的目的:
- 介绍MSanalyst,一个集成46个质谱相似性算法的平台.
- 为了提高对代谢物-代谢物光谱连接的检测.
- 在微生物系统中发现新的代谢物和代谢途径.
主要方法:
- 在MSanalyst平台上开发和集成46种不同的质谱相似性算法.
- 使用微生物代谢物数据集和超过300万个MS2光谱对的算法基准测试.
- 用MSanalyst应用于Kutzneria viridogrisea DSM 43850以发现代谢物.
主要成果:
- 互补的算法显著改善了对代谢物之间的光谱连接的检测.
- 在MSanalyst的帮助下,在Kutzneria viridogrisea中发现了一种新型的芳香糖化物,kutznaposides.
- 库兹纳酸C-F被发现起源于一种新型的menaquinone分流通道.
结论:
- 分析器增强了隐藏的代谢物和代谢途径的发现.
- 已识别的menaquinone分流通路有助于减轻氧化应激,并防止自我毒性.
- 这个平台具有显著的潜力,可以揭示微生物代谢物的生物功能.
