PoolSeq全基因组协会研究和微生物特征分析确定了与甲状腺耐药性相关的新型候选者 喀麦隆的Anopheles funestus的进化

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 医学昆虫学 医学昆虫学
• 进化生物学 进化生物学

背景情况:

• 疟疾载体,特别是Anopheles funestus的抗虫剂耐药性威胁着全球控制工作.
• 在Anopheles funestus中升级的杀虫剂耐药性的遗传基础尚未完全理解.

研究的目的:

• 为了研究基因组特征和进化机制,驱动Anopheles funestus种群的杀虫剂耐药性.
• 识别与抗虫剂耐药性相关的遗传标记物和微生物关联,以改进载体控制策略.

主要方法:

• PoolSeq对暴露于不同度杀虫剂的Anopheles funestus种群进行了全基因组分析.
• 使用F3交叉和时间人口比较 (2014-2021) 的基因组分析.
• 特定结构变异 (SV) 和单核酸多态 (SNP) 的组合基因定型,以及微生物组成分析.

主要成果:

• PoolSeq分析最初未能确定与耐药性相关的命中,但与敏感菌株相比,突出显示了rp1和CYP9位点.
• 基因组分析在rp1和CYP9区域中发现了显著的选择性扫描和新型多态,现场种群中的频率越来越高.
• 特定的变异,包括在rp1和CYP9K1 (G454A) 的4.3 kb SV,与超抗性表型密切相关.
• 伊丽莎白基尼亚 (Elizabethkingia anophelis) 的存在与抗杀虫剂耐药性相关,而塞拉提亚 (Serratia marcescens) 和阿萨亚 (Asaia bongorensis) 与易感性有关.

结论:

• 在rp1和CYP9区域的基因组进化,由新型多态和结构变异驱动,是Anopheles funestus抗昆虫剂耐药性的关键因素.
• 微生物共生体,特别是Elizabethkingia anophelis,可能在塑造抗昆虫剂表型方面发挥作用.
• 已识别的遗传事件和微生物关联提供了管理疟疾载体抗虫剂耐药性的潜在分子标记.