单细胞分析确定了与干细胞相关的瘤细胞亚群,并开发了食道状细胞癌的预后评分模型

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 癌症生物学 癌症生物学
• 免疫学 免疫学 免疫学

背景情况:

• 食道状细胞癌 (ESCC) 的特点是显著的异质性和患者的不良结果.
• 干细胞相关瘤细胞在ESCC异质性和预后中的作用尚不清楚.

研究的目的:

• 在ESCC中调查与干细胞相关的瘤细胞异质性.
• 开发基于茎状性标记物的预后评分系统.
• 探索茎度,瘤微环境和治疗点之间的关系.

主要方法:

• 用单细胞RNA测序来识别ESCC中的不同瘤亚群.
• 使用已识别的标记基因,开发了一种与茎度相关的评分模型 (SASM).
• 使用TCGA和GSE53624队列进行SASM的外部验证.
• 对SASM,免疫透,瘤突变负担 (TMB) 和基因表达进行了相关性分析.

主要成果:

• 在ESCC中确定了8个瘤亚群,其中一个具有干状和增殖特征 (高MKI67,STMN1,UBE2C).
• 较高的SASM得分与较短的整体存活率相关,减少CD8+T细胞透,增加瘤突变负担 (TMB).
• 高SASM和低TMB的患者表现最差.
• TFDP1被确定为与SASM和不良预后相关的关键基因,在体外促进ESCC细胞的增殖.

结论:

• 干细胞有助于瘤异质性,并影响ESCC的预后.
• SASM是一个有价值的预后工具,对瘤免疫微环境有影响.
• TFDP1代表了管理ESCC的潜在治疗目标.