基于转录基因组的模型用于预测HNSCC患者的放射治疗反应
Tomasz Kolenda1, Piotr Białas2, Alicja Braska3
1Laboratory of Cancer Genetics, Greater Poland Cancer Centre, Poznan, Poland.
概括
这项研究确定了抗放射治疗的头部和部状细胞癌 (HNSCCs) 的分子差异. 没有有效治疗的患者显示DNA修复基因表达增加,这表明放射电阻的潜在生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 头部和部状细胞癌 (HNSCCs) 主要通过手术和放射治疗来治疗.
- 瘤异质性和微环境影响放射治疗的成功,导致放射电阻.
- 在HNSCC中放射电阻的机制尚未完全理解,这在瘤学中构成了挑战.
研究的目的:
- 为了研究HNSCC有效和无效放射治疗结果的患者之间的分子差异.
- 在HNSCC中识别与放射治疗反应相关的潜在生物标志物.
主要方法:
- 来自癌症基因组图谱项目 (TCGA) 的放射治疗的HNSCC患者的回顾性分析.
- 排除患有HPV感染,化疗或向治疗的患者.
- 使用基因组丰富分析 (GSEA) 的临床病理和转录组数据 (RNAseq) 的比较.
主要成果:
- 确定了两个组:有效治疗组 (ETG,n=34) 和无效治疗组 (ITG,n=31).
- 与ETG患者相比,ITG患者的无进展间隔 (PFI) 显著较短 (中位数为266天,p < 0.0001).
- 分子分析显示,ITG组中DNA修复基因的表达显著增加.
结论:
- 在HNSCC中开发了一种分子独特的放射治疗反应模型.
- 基因表达的差异,特别是DNA修复途径的差异,是放射电阻的特征.
- 这些发现表明,该模型对于识别HNSCC放射电阻的生物标志物具有潜在的实用性.
