多态I类HLA基因的结构演变,指定HLA-C具有不确定的组合
Monikaben Padariya1, Natalia Marek-Trzonkowska1, Umesh Kalathiya1
1International Centre for Cancer Vaccine Science, University of Gdansk, ul. Kładki 24, Gdansk 80-822, Poland.
主体组织相容性复合体 (MHC) I类分子,像人类白细胞抗原 (HLA) 变体一样,显示了对T细胞反应至关重要的结构. 了解HLA结构多样性有助于为免疫受损患者设计疫苗.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 结构生物学 结构生物学
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 主体组织相容性复合体 (MHC) I 类分子,包括人类白细胞抗原 (HLA) 基因,对于适应性免疫和T细胞识别至关重要.
- 它们在ectodomains和跨膜区域中的高多态性和结构变异对理解抗原呈现提出了挑战.
- HLA分子的精确结构格局和进化多样性仍然不完全理解.
研究的目的:
- 为了研究整个家族的HLA-A,HLA-B和HLA-C等位基因中保存的结构特征.
- 假定全长的HLA结构并分析它们的差异.
- 为了将结构性质与结亲和力以及T细胞相互作用的潜力相关联.
主要方法:
- 对全家族保存的HLA-A,HLA-B和HLA-C等位基因的检查.
- 使用序列数据计算全长的HLA结构.
- 氨基酸保存,二次结构和内部能量的分析.
- 在不同HLA等位基家族的结构性质的比较.
主要成果:
- 在HLA分子中保存的氨基酸位于C端抗原结合点附近.
- 与HLA-B和HLA-C相比,HLA-A基因表现出更高的亲和力结构.
- 特定的等位基家族 (HLA-A*02,HLA-B*57,HLA-C*03) 显示了明确的二次结构.
- HLA-C等位基因表现出结构缺陷和较低的内部接触能量.
- 非表达的等位基具有较差的二次结构,表明呈现潜力降低.
结论:
- 细胞表面的HLA分子结构在结和选择性方面得到了优化.
- 对HLA等位基家族的结构洞察力揭示了影响免疫反应的独特特性.
- 内能量的量化可以评估HLA表达水平.
- 了解常见的HLA结构组件可以为免疫功能受损的个体提供基于的疫苗开发信息.
更多相关视频
09:32Immunopeptidomics: Isolation of Mouse and Human MHC Class I- and II-Associated Peptides for Mass Spectrometry Analysis
Published on: October 15, 2021
11:17Stability and Structure of Bat Major Histocompatibility Complex Class I with Heterologous β2-Microglobulin
Published on: March 10, 2021
相关概念视频
Protein Complexes with Interchangeable Parts
The SCF ubiquitin ligase is a protein complex of five individual proteins. This complex attaches ubiquitin to other target proteins to mark them for degradation. In order...
Multiple Allele Traits
Protein Complex Assembly
Many viruses self-assemble into a fully functional unit using the infected host cell to...
Diversity of Antigen Receptors
Before encountering any antigen, lymphocytes express these receptors. On B cells, the antigen receptor is a membrane-bound antibody molecule called BCR; on T cells, it is a T cell receptor or TCR. B and T cell receptors are composed of two...
Antigens Involved in Adaptive Immunity
Complete Antigens
Complete antigens possess both immunogenicity and...
Histone Variants at the Centromere
