一个近红外Aptamer:活细胞超分辨率RNA成像的染料系统
Simon Fürbacher1, Pia Doll1, Jingye Zhang1
1Institute of Pharmacy and Molecular Biotechnology (IPMB), Heidelberg University, 69120 Heidelberg, Germany.
Journal of the American Chemical Society
|January 8, 2026
概括
我们开发了SiRiuS, 一种用于活细胞RNA成像的近红外光吸收系统. 这种先进的探测器为超分辨率显微镜和动态RNA过程可视化提供了高性能.
科学领域:
- 分子生物学
- 生物化学
- 显微镜
背景情况:
- 罗达胺 (SiR) 探针为活细胞和超分辨率成像提供了优势.
- 光照明器 (FLAP) 是RNA可视化的新兴工具.
- 在基于FLAP的RNA成像中,SiR探测器未得到充分利用.
研究的目的:
- 开发一种基于SiR的高性能FLAP系统,用于哺乳动物活细胞中的RNA成像.
- 增强阿普坦-染料相互作用,以提高性和光稳定性.
- 实现动态RNA过程的时间分辨率和超分辨率成像.
主要方法:
- 结合进化的体进化 (FACS) 与理性设计,突变和切断.
- 有系统的化学衍生来改善SiR染料.
- 在活细胞成像和STED超分辨率显微镜中进行验证.
主要成果:
- 开发了具有高性和光稳定的SiRiuS:SiR-5染剂对.
- 证明强烈的光增强有效的活细胞RNA可视化.
- 启用了动态RNA过程的时间分辨率成像,例如压力颗粒的形成.
- 在STED超分辨率显微镜中成功应用该系统用于亚衍射极限RNA成像.
结论:
- SiRiuS:SiR-5系统是一个强大的NIR成像平台,用于活细胞中的RNA.
- 它有助于先进的应用,包括超分辨率RNA显微镜.
- 其与其他FLAP的正交性提高了其用于复杂RNA动态研究的实用性.
