便样本采集用于潜在队列中的肠道微生物组研究:澳大利亚突破性癌症研究中的试点研究
Simon Cheah1,2, Jared Burke3, Fiona J Bruinsma1,2,4
1Cancer Epidemiology Division, Cancer Council Victoria, Melbourne, Australia.
Cancer research communications
|January 9, 2026
概括
在大型肠道微生物组研究中,家庭便样本采集是可行的. 使用便隐性血液检测卡或乙醇管的方法产生了相似的结果,支持大规模分析.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 人类健康 人类健康 人类健康
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 对人类肠道微生物组的前性分析对于了解疾病发展至关重要.
- 肠道微生物组的变化在各种健康状况中起着重要作用.
研究的目的:
- 在一项大型队列研究中评估家庭便样本采集用于微生物组分析的可行性.
- 评估不同收集方法和问卷组件对参与者合规性和样本质量的影响.
主要方法:
- 一项试点研究将参与者随机分成根据便样本采集方法 (便隐性血液检测卡与乙醇管) 和问卷类型的组.
- 评估了参与者选择率,样本返回率和DNA质量/数量,以进行元基因组分析.
- 对配对样本进行全基因组测序和元基因组分析,以比较采集方法.
主要成果:
- 在1,093名受邀参与者中,有610人 (56%) 选择参加,其中88%的人返回了样本.
- 不同的采集方法和问卷补充 (48-51%) 的样本回报率是可比的.
- 便隐性血液检测卡和乙醇管均提供了足够的DNA质量和数量,产生了高度一致的微生物组概况.
结论:
- 在家收集便样本是大型前性微生物组研究的可行方法.
- 纳入额外的问卷或收集方法并没有显著降低参与者的合规性.
- 这种方法支持未来在队列研究中进行大规模的元基因组和宿主微生物组分析.
