鉴定和分析用于脂肪分化的关键 lncRNAs

科学领域:

• 脂肪组织生物学 脂肪组织生物学
• 肥胖研究的研究.
• 分子内分泌学分子内分泌学

背景情况:

• 棕色脂肪组织 (BAT) 丰富度与人类肥胖相反相关.
• 诱导白色脂肪细胞色是一种潜在的肥胖治疗策略.
• 长非编码RNAs (lncRNAs) 在脂肪细胞色中的作用在很大程度上是未知的.

研究的目的:

• 为了识别参与脂肪细胞色的新 lncRNA.
• 探索lncRNAs在脂肪细胞分化中的调节机制.
• 发现肥胖的潜在治疗点.

主要方法:

• 使用RNA-seq数据对小鼠白色,棕色和色脂肪组织进行转录基因分析.
• 生物信息工作流包括质量控制,对齐,组装,编码潜力评估和差异表达分析.
• 通过基因本体学 (GO) 和基因和基因组 (KEGG) 丰富的京都百科全书进行功能注释.
• 使用逆转录定量PCR (RT-qPCR) 验证关键的lncRNAs.

主要成果:

• 鉴定了794种新的lncRNA和1499种差异表达基因 (DEG).
• 在所有三种脂肪细胞类型中发现了95种常见的lncRNAs.
• 两种特定的lncRNAs (MSTRG.12661和MSTRG.17758) 与细胞外矩阵组织和脂肪酸氧化相关的特征.
• 功能预测,表明脂肪细胞分化中的潜在作用.

结论:

• 已经确定了调节脂肪细胞分化的新型lncRNAs.
• 这些lncRNAs可能通过白色脂肪组织色成为肥胖症治疗的新点.
• 对这些lncRNA的进一步研究可能会促进肥胖治疗.