在基因工程小鼠模型中,从肺腺癌组织中提取和分类GFP标记核的协议
Katherine Gillis1, Walter A Orellana1, Eric L Snyder2
1Huntsman Cancer Institute, University of Utah, Salt Lake City, UT, USA; Department of Oncological Sciences, University of Utah, Salt Lake City, UT, USA.
STAR protocols
|January 10, 2026
概括
这项研究详细介绍了将GFP阳性核从小鼠肺瘤中分离出来的协议. 这种方法支持高级分析,如染色体免疫沉测序 (ChIP-seq) 和全基因组甲基化研究.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- 基因工程小鼠模型 (GEMMs) 对于研究肺癌至关重要.
- 隔离特定的细胞群,如GFP阳性细胞核,对于详细的分子分析至关重要.
- 现有的方法可能无法有效地隔离各种下游应用的核.
研究的目的:
- 介绍一个详细的协议,以隔离GFP阳性核从小鼠肺瘤组织.
- 为了实现下游分析,如染色体免疫沉,其次是测序 (ChIP-seq) 和全基因组甲基化分析.
- 提供一种可适应的方法来检索其他被光标记的核.
主要方法:
- 从肺瘤组织中隔离固定的GFP阳性核,用于ChIP-seq.
- 在全基因组甲基化分析中对未固定的GFP阳性核进行分类.
- 使用光激活细胞分类 (FACS) 进行细胞核选择.
主要成果:
- 从GEMM肺瘤中成功分离了GFP阳性核.
- 该协议对固定和非固定核的应用性已被证明.
- 建立了进一步分子特征特定细胞群的基础.
结论:
- 本方案提供了一种可靠的方法,用于从肺部瘤中分离GFP阳性细胞核.
- 这种技术在癌症研究中促进了先进的基因组和表观基因组分析.
- 该方法可适应各种光标记物和下游应用.


