单核转录和染色质可访问性分析小鼠下丘脑LepRb神经元揭示了与人类肥胖相关的细胞类型特定的 cis-regulatory 元素

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 基因组学就是基因组学.
• 代谢研究研究 代谢研究

背景情况:

• 莱普受体表达的下丘脑神经元 (LepR Hypo) 对于调节能量平衡至关重要.
• 目前还缺少这些神经元的详细,细胞类型特定的染色质可访问性地图.

研究的目的:

• 创建一个全面的,细胞类型解析的色素可访问性图谱LepR Hypo神经元.
• 确定影响能量恒温和肥胖易感性的cis调节元素和遗传变异.

主要方法:

• 单核多原子测序 (snRNA-seq/snATAC-seq) 在大约20,000个LepRHypo核上进行.
• 生物信息分析确定了从转录和表观遗传学上不同的神经元及其调节元素.

主要成果:

• 确定了39个不同的LepR Hypo神经元集群,包括AgRP,Pomc和Glp1r表达群体的亚型.
• 集群特定的开放色素区域 (OCR) 被绘制为地图,揭示了假定的cis-regulatory元素.
• 保存的小鼠-人类OCR与与肥胖相关的基因,GWAS位点和影响能量平衡的eQTL有关.

结论:

• 这项研究提供了LepR Hypo神经元亚型的细胞类型特定的cis-regulatory图谱.
• 突出了与人类肥胖风险相关的进化保守的,亚型特定的调节元素和候选基因.
• 确定了影响LepR Hypo亚型功能和人类能量平衡的假定功能变异.