基于aptamer的方法用于敏感检测和SARS-CoV-2尖端蛋白的表位映射
Suttinee Poolsup1, Elnaz Yaghoobi1, Aliaksandra Radchanka1
1Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, Ottawa, ON K1N 6N5, Canada.
Molecular therapy. Nucleic acids
|January 16, 2026
概括
开发了针对SARS-CoV-2尖端蛋白的新型DNA吸收体. 这些体使得病毒的超敏感检测,并提供了针对不断演变的变种的新疗法的潜力.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- SARS-CoV-2尖峰 (S) 蛋白对于病毒进入至关重要,也是诊断和治疗的主要目标.
- 随着SARS-CoV-2变异的演变,需要不断开发有效的检测和治疗策略.
研究的目的:
- 选择和表征针对SARS-CoV-2 S1亚单元的新型DNA吸收体,包括Omicron变种.
- 评估这些体的诊断潜力和治疗应用.
主要方法:
- 通过指数式丰富 (SELEX) 进行体选择的联体的系统演化.
- 生物层干涉测量 (BLI) 用于表征阿普坦酶结合亲和力和选择性.
- 靠近结合试验与qPCR (PLA-qPCR) 结合用于超敏感检测.
- 质谱学,分子动力学和量子力学模拟用于表位图和相互作用分析.
主要成果:
- 三个DNA吸收体 (AptS1-tSP4,AptS1-tSP10,AptS1-tSP11) 显示了对S1子单元的纳米分子结合亲和力 (14-59nM).
- AptS1-tSP10对MERS-CoV具有很高的选择性,并在人类唾液和伪病毒样本中有效结合.
- 该PLA-qPCR试验达到3 pM的检测极限,超过了许多基于抗体的方法.
- 皮层映射确定了RBDVGGNYNYLYR作为AptS1-tSP10的结合部位,在不同的尖峰形状和变体中观察到稳定的相互作用.
结论:
- 新型DNA吸收剂为超敏感和表位特异性SARS-CoV-2检测提供了一个多功能平台.
- 这些体具有开发下一代诊断和基于核酸的治疗方法来对抗SARS-CoV-2和其他病毒感染的潜力.
