在埃塞俄比亚的Mizan Aman,通过快速诊断测试逃避检测的Plasmodium感染的分子,转录基因和蛋白质基因特性

科学领域:

• 疟疾学 疟疾学
• 分子生物学分子生物学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.

背景情况:

• 快速诊断测试 (RDT) 对疟疾病例管理至关重要,但在埃塞俄比亚准确检测寄生虫方面面临挑战.
• RDT的失败阻碍了有效的疟疾控制和消除策略,需要了解导致因素.

研究的目的:

• 调查RDTs在埃塞俄比亚检测Plasmodium falciparum感染的失败背后的分子和遗传因素.
• 在疑似疟疾的个体中,鉴定Plasmodium寄生虫DNA,物种,负载和基因删除 (pfhrp2,pfhrp3).

主要方法:

• 在埃塞俄比亚的Mizan Aman招募了148名疑似疟疾患者,并给他们提供了问卷和RDTs.
• 使用分子方法 (PCR) 检测寄生虫,物种识别和量化.
• 利用RNA-seq和LC-MS蛋白质组学来分析确诊的P. falciparum感染中的基因表达和蛋白质存在.

主要成果:

• 27.9%的个体对P. falciparum进行了PCR阳性检测,89.7%的个体通过RDT进行了假阴性检测.
• 93.1%的P.falciparum感染显示了pfhrp2和pfhrp3基因的缺失,75.9%的pfhrp2转录是可以忽略的.
• 通过LC-MS观察到没有可检测到的PfHRP2或PfHRP3,尽管在一些样本中可以检测到PfLDH.

结论:

• 分子,转录基因和蛋白质基因分析揭示了多种因素导致RDT在P. falciparum感染中的失败.
• 在pfhrp2和pfhrp3中的基因缺失,以及缺少标蛋白,是RDT表现不佳的重要原因.
• 解决 RDT 失败问题对于成功控制和消除埃塞俄比亚的疟疾至关重要.