通过使用SynthSeg进行对比和病理无知的临床胎儿大脑MRI细分,使用SynthSeg
Ziyao Shang1, Misha Kaandorp2, Kelly Payette3
1Center for MR Research, University Children's Hospital Zurich; Lenggstrasse 30, 8008 Zürich, Switzerland; Department of Computer Science, ETH Zurich; Universitätstr. 6, 8092 Zürich, Switzerland.
这项研究引入了一种新的采样策略,以提高使用深度学习的自动化胎儿大脑MRI细分. 该方法增强了对不同大脑结构的网络通用性,特别是在病理病例中.
科学领域:
- 医疗成像医学成像
- 神经科学是一个神经科学.
- 人工智能的人工智能
背景情况:
- 磁共振成像 (MRI) 对于胎儿神经发育研究至关重要.
- 使用深度学习 (DL) 对胎儿大脑MRI的自动结构注释对于定量分析至关重要.
- 卷积神经网络 (CNN) 经常与域移动作斗争,限制了对不同主题数据的性能.
研究的目的:
- 训练DL网络,使胎儿大脑MRI在各种领域转移中进行强大的自动细分,包括生理和获取差异.
- 增强细分网络的域概括性,特别是在病理病例中的基于形状的异常.
主要方法:
- 引入了一种新的数据驱动的列车时间采样策略,以最大限度地提高训练数据集的多样性.
- 调整了采样策略,并在SynthSeg框架内整合了现有的数据增强技术.
- 在SynthSeg中利用域随机化生成多样化的训练数据,以增强网络通用化.
主要成果:
- 在具有显著解剖异常 (p < 1e-4) 的胎儿大脑MRI的细分质量方面取得了显著的改进.
- 观察到在异常较少的病例中,表现略有下降,这表明在概括性方面存在权衡.
- 证明了数据驱动抽样策略在改善域概括方面的有效性.
结论:
- 开发的数据驱动采样策略显著提高了DL网络用于胎儿大脑MRI细分的域概括性.
- 这种方法对细分有病理形状差异的大脑具有特别的希望.
- 这项工作为开发其他AI驱动的医学成像管道中的适应性数据驱动采样策略提供了基础.
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