在宫癌中SRPK1抑制下的HPV驱动的转录组和拼接重新连接在SRPK1抑制下
Afra Basera1,2, Mohammed Alaouna1, Janie Duvenhage3,4
1SAMRC Precision Oncology Research Unit (PORU), DSTI/NRF SARChI Chair in Precision Oncology and Cancer Prevention, Pan African Cancer Research Institute (PACRI), University of Pretoria, Hatfield, Pretoria, South Africa.
血清/氨酸蛋白激酶1 (SRPK1) 抑制对HPV阳性与HPV阴性宫癌细胞的基因表达和替代拼接有不同的影响. 阳性HPV细胞表现出抑制的瘤信号,而阴性HPV细胞则经历代谢重编程.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 癌症研究 癌症研究
- 在RNA分离过程中.
背景情况:
- 氨酸/氨酸蛋白激酶1 (SRPK1) 通过化氨酸-氨酸丰富 (SR) 蛋白来调节替代拼接.
- SRPK1在依赖HPV的转录组和子宫癌中的拼接中的作用尚未完全理解.
- 研究SRPK1对HPV阳性和HPV阴性宫癌细胞的基因表达和剪接的影响至关重要.
研究的目的:
- 确定SRPK1抑制如何在HPV阳性与HPV阴性宫癌细胞中差异性重塑基因表达和替代拼接.
- 阐明不同HPV环境中SRPK1抑制引起的明显的转录和拼接变化.
- 探索针对宫癌中SRPK1的潜在治疗策略.
主要方法:
- 用SRPK1抑制剂SPHINX31治疗HPV16阳性SiHa和HPV阴性C33A宫癌细胞.
- RNA分析以识别差异表达的基因和替代拼接 (AS) 事件 (表子跳转,内子保留等). ) 的情况.
- 生物信息分析包括路径丰富 (基因本体学/KEGG),蛋白质-蛋白质相互作用网络 (STRING/MCODE) 和分子对接 (SP/XP,MM-GBSA).
主要成果:
- 抑制SRPK1诱导了与HPV相关的独特反应. 阴性C33A细胞对翻译,RNA处理和代谢途径表现出丰富性,其中核糖体枢纽占主导地位.
- 阳性SiHa细胞在Hippo,Wnt,PI3K-AKT和ERK1/2信号通路中的基因表达减少,抑制了YAP/TAZ标.
- SiHa细胞的AS事件较少,但效果大小较大 (A3SS/A5SS),而C33A细胞显示出大量的外子跳转和内子保留,在特定的基因中具有显著的拼接开关.
结论:
- 抑制SRPK1以HPV依赖的方式重塑宫癌转录组.
- 阳性HPV细胞表现出抑制的瘤信号,而阴性HPV细胞通过转化和代谢重编程来适应.
- 这些发现表明,基于宫癌的HPV状况,有明显的治疗脆弱性和适应机制.
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