液体活检常规临床使用的预分析框架:结合EVs和cfDNA
Nike K Simon1,2,3, Stefanie Volz1,2,4, Jussara Rios de Los Rios Reséndiz5,6
1Division of Pediatric Neurooncology, German Cancer Consortium (DKTK), German Cancer Research Center (DKFZ) Heidelberg, Heidelberg 69120, Germany.
为液体活检采集血液的标准化改善了无细胞DNA (cfDNA) 和细胞外囊泡 (EV) 分析. 条纹RNA管为多组生物标志物研究提供了最稳定的性能.
科学领域:
- 生物标志物发现发现
- 液体活检技术液体活检技术
- 预分析标准化 预分析标准化
背景情况:
- 液体活检提供了极小侵入性的诊断潜力.
- 无细胞DNA (cfDNA) 的临床应用正在增长.
- 细胞外囊泡 (EVs) 面临着分析前的可变性挑战.
研究的目的:
- 标准化血液采集,同时进行cfDNA和EV隔离.
- 评估血液采集管用于多组生物标志物分析.
- 评估液体活检样本处理中的分析前变化.
主要方法:
- 血液保存管和储存条件的比较.
- 使用超离心法和尺寸排除染色法分离大型电动汽车 (lEV) 和小型电动汽车 (sEV).
- 进行了cfDNA提取,测序和EV蛋白质基因分析.
主要成果:
- 链条RNA,诺根和PAX管保持了cfDNA纯度7天.
- 条形RNA管表现出多组学中最稳定的性能.
- 小型EV (sEV) 在储存7天后,与大型EV (lEV) 相比,显示出更大的蛋白质可变性.
结论:
- 一个标准化的工作流程使得能够明智地选择液体活检管.
- 该协议有助于检索基因组和EV蛋白质组数据.
- 这种方法支持用于液体活检的多组生物标志物发现.
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