对从家禽中分离出来的Erysipelothrix rhusiopathiae菌株进行比较的表型和基因型分析
Ádám Kerek1,2, Gergely Tornyos1, Eszter Kaszab2,3,4
1Department of Pharmacology and Toxicology, University of Veterinary Medicine Budapest, H-1078 Budapest, Hungary.
与家禽相关的Erysipelothrix rhusiopathiae中的抗微生物耐药性 (AMR) 正在出现,检测到了四环素和花醇耐药性. 移动基因因素推动了这些抗药性基因的传播,需要对家禽进行AMR监测,以防止动物传播的风险.
科学领域:
- 兽医微生物学 兽医微生物学
- 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 埃里西佩洛特里克斯 (Erysipelothrix rhusiopathiae) 是家禽中一个重要的动物性传染病原体.
- 关于禽类E. rhusiopathiae的抗菌素耐药性 (AMR) 动态的了解有限.
- 由于亚治疗性抗菌剂的使用,家禽分离物可能含有不充分表征的耐药性基因.
研究的目的:
- 调查来自家禽的Erysipelothrix rhusiopathiae的表型和基因型抗菌耐药性概况.
- 在鸟类分离物中识别AMR决定因素和移动遗传元素.
- 评估来自家禽的 E. rhusiopathiae 菌株之间的遗传关系.
主要方法:
- 对38种E. rhusiopathiae菌株的表型抗菌感应性测试,使用苏微稀释对18种药物进行测试 (CLSI指南).
- 19个耐药菌株的全基因组测序.
- 生物信息分析包括新组合,基因注释,移动元素检测和家族基因推断.
主要成果:
- 所有的分离物仍然对β-乳糖胺和第三代质素敏感.
- 观察到的最常见的耐药性是对四环素 (10.5%) 和佛罗芬尼科尔 (5.3%) 的.
- 基因组分析确定了与移动元素相关的四环素耐药基因 (tetM,tetT) 和红色素耐药基因 (erm(47);在一种菌株中发现了一种携带 ermC 的新型基因组岛屿.
结论:
- 移动抗微生物耐药性决定因素正在与家禽相关的E. rhusiopathiae中出现.
- 横向基因转移可能有助于耐药性的发展,即使是染色体融合.
- 基因组同质性表明克隆扩张,突出了针对家禽的AMR监测的必要性,以减轻动物传播的传播.
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