贝莱峰会的分析验证和临床敏感性TM 2.0脑脊液液体活检测-用于中枢神经系统恶性瘤的扩展综合基因组分析平台

科学领域:

• 神经瘤学神经瘤学
• 基因组学就是基因组学.
• 分子诊断学 分子诊断

背景情况:

• 国家综合癌症网络 (NCCN) 的指导方针建议下一代测序 (NGS) 用于中央神经系统 (CNS) 恶性瘤的综合基因组分析 (CGP).
• 由于患者因素和血脑屏障 (BBB) 限制了血液体活检,以组织为基础的中枢神经系统瘤测试往往是不可行的.
• 大脑脊髓液 (CSF) 为检测瘤衍生的核酸提供了一个可行的替代方案.

研究的目的:

• 通过分析和临床验证Belay SummitTM 2.0试验进行中枢神经系统瘤综合基因组分析 (CGP).
• 用脑脊液 (CSF) 作为瘤衍生的核酸来源来评估试验的性能.
• 为了确定基于CSF的CGP对中枢神经系统恶性瘤的临床实用性.

主要方法:

• 贝莱峰会TM 2.0是一种高通量CGP试验,检测单核酸变异 (SNV),小插入和删除 (Indels),复制数变异 (CNV),基因融合,拼接变异,微卫星不稳定性 (MSI) 和瘤突变负担 (TMB).
• 分析验证使用了68个样本,其中15 ng的CSF衍生的总核酸 (tNA),评估了所有变异类型的检测.
• 临床有效性涉及来自中枢神经系统原发性和转移性瘤患者的118个脑脊髓样本.

主要成果:

• 分析验证表明,通过15 ng的CSFtNA,对所有变异类型的稳定检测.
• 该试验实现了SNV和Indels的96.7%的分析灵敏度,在0.3%的变异异基因频率下具有100%的检测极限 (LoD).
• 临床评估显示96%的灵敏度和98%的特异性通过CSF检测中枢神经系统瘤中的基因组变化.

结论:

• 贝莱峰会TM 2.0测定提供了使用CSF的中枢神经系统瘤的准确和可重现的基因组分析.
• 这种基于CSF的方法适用于基于组织的测试是不可行的,不安全的或临床上不适合的患者.
• 这些发现支持临床采用CSF液体活检用于中枢神经系统恶性瘤的分子特征.