在南非药用植物中使用双电喷射电离化代谢学来识别关键代谢物
Mmamudi Anna Makhafola1, Clarissa Marcelle Naidoo1, Chikwelu Lawrence Obi1
1Department of Biology and Environmental Sciences, Sefako Makgatho Health Sciences University, Pretoria 0204, South Africa.
这项研究使用双极性UPLC-MS/MS.绘制了南非药用植物Acorus calamus和Lippia javanica的代谢组图. 该方法确定了具有有利药物相似性的潜在抗病毒化合物,将化学特征与SARS-CoV-2抑制联系起来.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 药理学是指药理学,即药理学是指药理学.
- 药用化学 医学化学
背景情况:
- 南非药用植物的兴趣越来越大,但先进的代谢分析尚未得到充分利用.
- 黑树 (Acorus calamus) 和白树 (Lippia javanica) 是关键物种,需要详细的化学分析.
- 整合双极性液态染色学-并联质谱学 (UPLC-MS/MS) 提供了增强的代谢组覆盖.
研究的目的:
- 应用一个双极性UPLC-MS/MS工作流程来绘制Acorus calamus和Lippia javanica的代谢组.
- 为了识别和排名潜在的签名代谢物用于抗病毒药物发现.
- 评估已识别的代谢物的细胞毒性和in silico药物相似性.
主要方法:
- 使用正 (ESI+) 和负 (ESI-) 电离模式进行非定向的UPLC-MS/MS分析.
- HEK293T细胞毒性查和瑞士ADME分析在体中药物相似性.
- 多变量统计分析 (PCA) 和差异分析,以分离物种和识别重要的代谢物.
主要成果:
- 双极性分析扩大了代谢组覆盖范围,ESI-产生了比ESI+更多的特征.
- 两种植物提取物都没有表现出细胞毒性.
- 差异分析确定了重要的代谢物,包括黄醇,虹膜糖化物和斯酸盐通路氧利平,ESI-显示了更广泛的动态范围.
- 在实验室中观察到SARS-CoV-2类似帕帕因蛋白酶 (PLpro) 的抑制,将化学特征与抗病毒活性联系起来.
结论:
- 双模式的UPLC-MS/MS方法为南非药用植物提供了全面的代谢组覆盖和安全数据.
- 这种方法有助于识别具有有利药物相似性的潜在抗病毒代谢物.
- 这些发现支持使用Acorus calamus和Lippia javanica进行下游抗病毒研究.
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