单核酸多态信息估计了食品中的品种和品种组成比例

科学领域:

• 遗传学 是一个遗传学.
• 食品科学 食品科学 食品科学
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 食品产品质量受到原产品品种或品种的影响.
• 在混合品种或混合品种的食品样本中确定精确的成分比是具有挑战性的.
• 准确的可追溯性和质量控制依赖于了解成分来源.

研究的目的:

• 开发和验证一种用于估计食品样本中品种或品种组成比率的新方法.
• 为了利用单核酸多态性 (SNP) 的等位基频率数据进行准确的混合物分析.
• 为食品可追溯性和质量评估提供计算工具.

主要方法:

• 利用来自食品样本的单核酸多态化 (SNP) 基因基因频率数据.
• 应用了非负最小平方 (NNLS) 优化方法来估计组合比.
• 模拟牛和可可数据集与已知的品种组成,以评估方法性能.

主要成果:

• 与统一的概率基线相比,开发的方法显著降低了估计品种组成的平均绝对误差 (牛的4.1%与24.6%,可可的11.8%与24.6%).
• 确定大多数品种或品种的准确性远高于随机机会 (92%的奶牛,72%的可可).
• 该方法在两个数据集中都显示出高统计意义 (p < 1.1 × 10-8).

结论:

• 使用SNP数据的NNLS优化方法为估计食品中的品种或品种组成提供了强大而准确的方法.
• 这种方法为食品的可追溯性和质量控制提供了显著的准确性改进和错误减少.
• 计算代码是公开可用的,促进了更广泛的采用和进一步的研究.