使用环境DNA (eDNA) 对脆弱的亚马逊海进行调查:一种在偏远的现场环境中进行调查的方法
Kaitlyn Romoser1, Shizuka Hashimoto2, Nasrah M C Hamdan2
1Department of Ecology and Conservation Biology, Texas A&M University, College Station, Texas, United States of America.
环境DNA (eDNA) 检测到亚马逊海 (Trichechus inunguis) 在不太干扰的亚马逊西部水域更频繁. 这种方法为追踪偏远地区的脆弱水生哺乳动物提供了一个有前途的工具.
科学领域:
- 保护生物学 保护生物学
- 环境DNA (eDNA) 分析分析
- 水生哺乳动物研究
背景情况:
- 亚马逊海 (Trichechus inunguis) 是唯一的淡水海,由于非法狩猎,污染和息地破坏,它们面临着脆弱性.
- 准确的分布和丰度数据对于保护这种难以捉摸的物种至关重要.
- 传统的调查方法在亚马逊复杂的河流系统中具有挑战性.
研究的目的:
- 在亚马逊河流域的干扰梯度中使用环境DNA (eDNA) 评估亚马逊海的存在.
- 为热带环境中的eDNA研究开发和验证一个现场友好的DNA保存技术.
- 为了比较不同程度的人类影响的地区的eDNA检测率.
主要方法:
- 从亚马逊河及其支流沿线的三个地点 (特菲,马纳乌斯,贝莱姆) 收集了水样.
- 利用一种新的现场方法,在不需要冷藏的情况下保存DNA,保持样本完整性长达13天.
- 提取了DNA,进行PCR放大,并进行了Illumina测序来检测Trichechus inunguis eDNA.
主要成果:
- 在亚马逊西部 (Tefé/Mamirauá) 的亚马逊海DNA检测率是人类活动较低的三倍以上.
- 在马纳乌斯附近的6个地点和贝莱姆附近的2个地点检测到海的DNA,与增加的人口和影响相关.
- 开发的现场保存方法的有效性与传统的冷藏技术相美.
结论:
- 环境DNA (eDNA) 是检测亚马逊海的有效工具,即使在具有挑战性的热带河流环境中也是如此.
- 电子DNA调查显示,在亚马逊西部受影响较小的地区,海的流行率更高.
- 经过验证的eDNA方法对更广泛的分布评估和在亚马逊盆地调查其他水生物种具有重大潜力.
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