基因组测序在患有渐进性运动障碍的儿童的诊断产量

科学领域:

• 遗传学 是一个遗传学.
• 神经学 神经学
• 基因组医学是基因组医学.

背景情况:

• 儿童发病的运动障碍在遗传上是多样化的,涉及500多个基因.
• 标准的遗传测试,如外体测序,错过了某些变体类型 (例如,重复扩张,结构变体).

研究的目的:

• 评估短读全基因组测序 (srWGS) 和长读基因组测序 (lrWGS) 在儿童运动障碍患者的诊断价值,先前进行了非诊断性遗传测试.
• 为了识别新的遗传变异,并改善诊断产量在一个队列的年轻人与渐进的运动障碍.

主要方法:

• 招募了100名 (<30岁) 具有进展性运动障碍和先前非诊断性遗传测试的个人.
• 对所有参与者进行了srWGS,对14个未解决的三组进行了irrWGS.
• 利用多学科审查来解释变体和表型相关性.

主要成果:

• 在27%的病例中 (27/100) 取得了分子诊断;在另外33%的病例中发现了候选变体.
• 基因组级分析提供了额外的5%的诊断收益率,识别出异构体测序遗漏的变异 (例如,重复扩张,插入,重复).
• 33.3%的解决案例涉及先前报告但未被认可的诊断变异,突出解释挑战.

结论:

• 对于早期发作的运动障碍,SrWGS比外体序列测序提供了适度的增量诊断产量.
• 对外基层数据的重新分析和改进的变体解释对于最大限度地提高诊断产量至关重要.
• 需要进一步开发分析管道,以充分利用复杂遗传疾病的基因组测序.