液体染色学的可比性 串联质谱 实验室间溶解有机物质的分析
Jarmo-Charles Kalinski1,2, Bruno Ruiz Brandão da Costa1,3, Tilman Schramm1
1Department of Biochemistry, University of California Riverside, Riverside, California 92521, United States.
标准化非向液体色谱学并行高分辨率质谱学 (LC-MS/MS) 分析溶解有机物 (DOM) 显示了实验室对高强度特征的可比结果. 低强度特征表现出可变性,突出了对可重复化学分析的标准化方法的需求.
科学领域:
- 环境化学环境化学
- 分析化学 分析化学
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 非向液体色谱协同高分辨率质谱 (LC-MS/MS) 对于分析溶解有机物 (DOM) 至关重要.
- 实验室间LC-MS/MS数据的可复制性和可比性仍然是大规模数据分析和重复使用的挑战.
- 了解实验室间的变异性对于从公共DOM数据集推断全球趋势至关重要.
研究的目的:
- 评估不同实验室为DOM分析生成的LC-MS/MS数据的可比性.
- 识别导致数据变化和差异的仪器仪表因素.
- 为改善DOM化学分析中的标准化和数据共享提供建议.
主要方法:
- 一个涉及24个实验室的环状试验分析了相同的藻类和DOM提取物样本.
- 采用了标准化的数据分析管道,包括经典 (CMN) 和基于特征的分子网络 (FBMN).
- 分析了各种质谱仪类型和仪器参数的数据.
主要成果:
- 来自具有统一参数的类似质谱仪类型的数据显示了定性可比性,并解决了类似的趋势.
- 高强度特征显示出比低强度特征更好的实验室间可比性,而低强度特征显示出更大的检测可变性.
- 在比较不同收购率或非标准化方法的工具数据时发现了挑战.
结论:
- 标准化的LC-MS/MS方法和统一的仪器参数提高了用于DOM分析的数据可比性.
- 解决低强度特征检测的变异性和标准化采集方法对于强大的实验室间比较至关重要.
- 提供了数据集成,共享和最佳实践的建议,以促进长期时间序列和可相互比较的DOM化学分析.
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