交叉电离模式在代谢学中的双重质谱之间的化学相似性预测
Niek F de Jonge1, Elena Chekmeneva2, Robin Schmid3,4
1Bioinformatics Group, Wageningen University & Research, Wageningen, the Netherlands. niek.dejonge@wur.nl.
MS2DeepScore 2.0是一个新的机器学习工具,可以预测不同电离模式的质谱碎片化光谱之间的化学相似性. 这增强了非目标的代谢学数据探索和代谢物注释.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 计算化学计算化学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 质谱测量对于非目标代谢学至关重要.
- 通过积极和消极的电离模式来比较代谢物数据是具有挑战性的,因为不同的碎片化模式.
研究的目的:
- 开发一种机器学习模型,MS2DeepScore 2.0,用于预测质量碎片化谱之间的化学相似性.
- 为了在非目标代谢学中实现交叉电离模式比较.
主要方法:
- 开发了MS2DeepScore 2.0,一种预测光谱相似性的机器学习模型.
- 实施了一种质量估计方法,以标记低质量或不相似的频谱.
主要成果:
- MS2DeepScore 2.0 准确地预测不同电离模式的光谱之间的化学相似性.
- 在交叉电离模式分子网络中证明了实用性,用于增强数据探索和代谢物注释.
- 质量估计通过识别不可靠的光谱来最大限度地减少错误的预测.
结论:
- MS2DeepScore 2.0克服了在离子化模式中比较质谱数据的挑战.
- 该工具改进了对非目标代谢学资料的组织,探索和注释.
- 提高了质谱在代谢学研究中的实用性.
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