多种麦冠状分离物的哈普洛型解析基因组揭示了长寿克隆哈普洛型的全球分散,具有有限的重组
Eva C Henningsen1, Eric S Nazareno2, Rebecca Spanner3
1CSIRO, Agriculture and Food, Building 801, Clunies Ross Street, Canberra, Australian Capital Territory, Australia, 2601; Eva.Henningsen@csiro.au.
普奇尼亚冠状植物 f. sp. 一种真菌病原体Pca表现出全球移动性和持久的克隆系,罕见的重组. 这项研究扩大了其单 haplotype 集合,以更好地监测和鉴定毒性.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 基因组学就是基因组学.
- 进化生物学 进化生物学
背景情况:
- 普奇尼亚冠状植物 f. sp. avenae (Pca) 迅速演变为毒性,适应新的麦品种.
- 了解Pca的遗传多样性对于管理皇冠病至关重要.
研究的目的:
- 通过生成和分析核单元型解析基因组来描述Pca的全球遗传变异.
- 调查群体结构,重组和Pca.中长期存在的克隆单元类型的潜力.
主要方法:
- 产生了来自欧洲,非洲和中东的十个Pca分离物的哈普洛型解析基因组.
- 将这些与现有的美国和澳大利亚隔离基因组进行比较,分析了总共52个单元型.
- 研究了重组事件,并在一个隔离物中确定了一个超数的染色体.
主要成果:
- 在52个单元中确定了40个独特的单元类型,表明了显著的遗传多样性.
- 发现了长寿的证据,全球交换的克隆性单元类型,与罕见的重组.
- 在非核心基因组中观察到异位基因特异性表达,富含效应蛋白.
结论:
- Pca种群是全球移动的,由持久的克隆血统主导,偶尔会进行重组.
- 扩展的哈普洛型数据将有助于开发监控技术和识别毒性因素.
- 发现一个超数的染色体表明Pca.复杂的基因组进化.
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