生物信息学表征和MARCKS和MLP基因的组织特异表达在再生的Cynops orientalis中
Le Shui1, Ya-Long Feng2, Wen-Hui Liu1
1Department of Life Science, Xianyang Normal University, No.43 Wenlin Road, Xianyang, 712000, Shaanxi, China.
基化氨酸丰富的C-激酶基质 (MARCKS) 和MARCKS样蛋白 (MLP) 对于新肢体的再生至关重要. 它们的保存域和酸化部位表明它们在蛋白质功能中起着重要的作用,在肝脏和胃中显著表达.
科学领域:
- 两动物生物学
- 分子生物学分子生物学
- 再生医学是一种再生医学.
背景情况:
- 富含氨酸的C-激酶基质 (MARCKS) 和类似MARCKS的蛋白质 (MLP) 对于轴突肢体的再生至关重要.
- 马克斯和MLP在新再生中的特定作用和特征尚未得到充分理解.
研究的目的:
- 调查东方火腹新 (C. orientalis) 中MARCKS和MLP的生物信息学特征和组织表达特征.
- 阐明MARCKS和MLP在新肢体再生中的作用的分子基础.
主要方法:
- 获取并分析了C. orientalis MARCKS (Co-MARCKS) 和MLP (Co-MLP) 的开放读取框架 (ORF) 序列.
- 进行了全面的生物信息学分析,包括域识别和酸化地点预测.
- 使用定量方法进行了组织表达分析.
- 进行了遗传学分析以确定进化关系.
主要成果:
- 共同MARCKS和共同MLP的ORF分别为837bp (278aa) 和684bp (227aa),两种蛋白质都富含随机线圈,缺乏信号.
- 这两种蛋白质都具有保留的域:N-终端密里斯基化基因,MARCKS同质域2和效应域.
- 在Co-MARCKS中确定了8个潜在的化位点,在Co-MLP中确定了5个潜在的化位点,其中关键位点位于效应器域中.
- 遗传学分析显示,Co-MARCKS和Co-MLP与Pleurodeles waltl最为密切的关系.
- 在肝脏,脏,胃和肠道检测到基因表达,与脏和肠道相比,肝脏和胃中的Co-MLP表达显著更高.
结论:
- 新MARKS和MLP的动态结构和酸化模式对于它们的功能至关重要.
- 这项研究为未来研究关于MARCKS和MLP在新肢再生中的作用提供了基础的理解.
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