网络毒理学,分子对接和多层次生物信息学集成揭示了佐[a]皮林暴露与缺血性中风相关的目标和机制

科学领域:

• 环境毒理学环境毒理学
• 生物信息学是一种生物信息学.
• 分子生物学分子生物学
• 脑卒中病变的发生因子

背景情况:

• 像甲 (BaP) 这样的环境毒素越来越多地与各种疾病有关.
• BaP对缺血性中风 (IS) 病原发生的具体机制尚不清楚.
• 了解这些机制对于制定针对性预防和治疗IS的策略至关重要.

研究的目的:

• 阐明导致BaP诱导的缺血性中风 (IS) 的分子机制.
• 确定关键的分子标和涉及到BaP对IS影响的途径.
• 评估已识别的IS生物标志物的诊断和预测潜力.

主要方法:

• 采用了综合网络毒理学,分子对接和多层次生物信息学分析.
• 从多个数据库 (STITCH,ChEMBL,GeneCards,OMIM,TTD) 中确定了与BaP和IS相关的目标.
• 进行了差异基因表达分析 (GSE58294,GSE22255),RT-qPCR验证,免疫透分析和名录构造.
• 分子对接模拟评估了BaP-目标相互作用.

主要成果:

• 确定了BaP和IS的21个共同目标,形成了一个分子监管网络.
• 功能性丰富分析强调了炎症反应和脂质代谢途径的参与.
• 确定了MMP9和PTGS2作为关键基因,在IS患者中显著上调 (P < 0.001),并与BaP具有强烈的结合亲缘关系.
• 一个名图显示了强大的IS风险预测性能 (AUC = 0.753,外部验证AUC = 0.906).

结论:

• [a]烯 (BaP) 可能通过调节MMP9和PTGS2.2来促进缺血性中风 (IS) 的发病.
• 这些关键基因影响炎症反应,免疫细胞透和脂质代谢.
• MMP9和PTGS2显示出作为IS诊断生物标志物的潜力,为与环境毒素相关的中风提供了洞察力.