产生细菌素的Lactococcus lactis亚种的完整基因组序列. DOME 6301具有潜在的口腔病原体控制应用

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 细菌学 细菌学是一门学科.

背景情况:

• 乳球菌乳酸菌亚种. 从牛奶中分离出来的 lactis DOME 6301 具有针对口腔病原体的抗微生物特性.
• 口腔病原体,如菌突变菌,Prevotella intermedia和Fusobacterium nucleatum造成了严重的健康问题.

研究的目的:

• 为了执行 de novo 全基因组测序和注释的乳球菌乳糖 DOME 6301.1.
• 确定负责抗微生物化合物生产,碳水化合物代谢和潜在毒性因素的基因.
• 评估L. lactis DOME 6301作为益生菌候选人的潜力.

主要方法:

• 使用PacBio RS II平台进行全基因组测序.
• 新的基因组组装和注释.
• 生物信息分析以确定基因功能.

主要成果:

• L. lactis DOME 6301 的基因组为 2,532,858 个基因组,其 G+C 含量为 35%,组装成三个结合体.
• 标注确定了2,469个蛋白质编码序列,22个rRNA基因和78个tRNA基因.
• 检测到的基因涉及复杂碳水化合物利用 (纤维素,纤维素等). ),尼辛Z细菌素合成,抗菌素耐药性,血解素和肠毒素.

结论:

• 基因组分析提供了对L. lactis DOME 6301.1的代谢能力和潜在应用的见解.
• 细菌素合成和抗菌素耐药性基因的存在支持其作为益生菌的潜力.
• 了解基因组有助于选择L. lactis DOME 6301用于特定的下游应用,包括口腔健康.