探索性识别COL1A1作为一个潜在的基因,将内分泌破坏性化学物质和肺腺癌联系起来:生物信息学和机器学习分析
Tianyu She1, Fanting Sun2, Zhen Xie1
1Department of Thoracic Surgery, Binzhou Medical University Hospital, Binzhou, 256600, China.
BMC pharmacology & toxicology
|February 17, 2026
概括
这项研究将内分泌干扰化学物质 (EDC) 与肺腺癌 (LUAD) 联系起来,通过确定COL1A1作为关键基因. 在LUAD中,COL1A1影响瘤微环境和免疫细胞模式.
科学领域:
- 环境健康 环境健康
- 在瘤学瘤学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 内分泌干扰化学物质 (EDC) 是与各种癌症有关的环境污染物.
- EDCs影响肺腺癌 (LUAD) 发展的具体机制尚不清楚.
研究的目的:
- 研究将EDC暴露与LUAD发展联系在一起的分子机制.
- 通过生物信息学和机器学习,确定涉及EDC诱导LUAD的关键基因和途径.
主要方法:
- 利用生物信息学和机器学习来分析来自数据库 (ChEMBL,STITCH,SwissTargetPrediction) 和GEO数据集的数据.
- 雇佣权重基因共同表达网络分析 (WGCNA),蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络,以及用于基因优先级的机器学习.
- 进行了基因组丰富分析 (GSEA),基因组变异分析 (GSVA) 和CIBERSORT用于途径和免疫细胞透分析.
主要成果:
- 鉴定了1,818个潜在的EDC标基因,使用WGCNA精制为93个候选基因.
- 优先考虑COL1A1作为关键特征基因,与LUAD和EDC暴露相关.
- 发现COL1A1参与了细胞因子受体相互作用,ECM相互作用和脂肪酸代谢,并与特定的免疫细胞群 (M0/M2巨细胞,单细胞,乙酸细胞) 相相关.
结论:
- 确定了COL1A1作为关键基因,将EDC暴露途径与LUAD联系起来.
- 描述了 COL1A1 在细胞外基质 (ECM) 信号传递中的作用及其与 LUAD 中独特的免疫透模式的关联.
- 提供了一个计算框架,以了解在LUAD中EDC驱动的分子变化.
