植物学方法:植物合成生物学可访问的自动化

科学领域:

• 合成生物学 合成生物学
• 分子生物学分子生物学
• 生物工程是生物工程.

背景情况:

• 对液体处理机器人的有限访问阻碍了合成生物学中的实验规模和可重复性,特别是对于植物科学家来说.
• 高吞吐量生物矿是资本密集型的,并且没有广泛的可访问性,而负担得起的3D打印机器人缺乏经过验证的,用户友好的协议.
• 对于具有不同技术专业知识的研究人员来说,需要可访问的自动化解决方案来简化复杂的分子生物学工作流程.

研究的目的:

• 使用Opentrons OT-2机器人开发一系列用于常见分子生物学任务的模块化,用户友好的自动化协议.
• 提高不同培训水平的研究人员对生物自动化的可访问性,从学生到高级科学家.
• 通过自动化工作流来简化合成生物学中的设计,构建,测试,学习循环.

主要方法:

• 开发适合Opentrons OT-2液体处理机器人的模块化BOTany方法.
• 创建一个全面的工作流程,自动化各种分子生物学程序,包括原料稀释,PCR设置,植物模块化克隆 (MoClo),细菌转化和等离子体提取.
• 实现基于表的输入系统,允许用户在没有自定义 Python 脚本的情况下运行实验.

主要成果:

• 成功自动化了广泛的分子生物学程序,从简单的稀释到复杂的克隆和转换.
• 启用端到端分子克隆,用户干预最小,显著提高吞吐量和可追溯性.
• 为生物自动化提供了一个经过验证,可访问的平台,可供不同级别编码和机器人经验的个人使用.

结论:

• 博塔尼方法提供了一个可扩展和可重复的解决方案,用于自动化分子生物学工作流程,增加生物自动化的可访问性.
• 这种方法使研究人员能够加速合成生物学中的设计,构建,测试,学习循环,促进创新.
• 开发的方法促进了高通量数据采集和生物产品开发,弥合了研究需求和自动化可访问性之间的差距.