印度社区环境中的抗菌素耐药性尿病原体的表型和基因型表征:一个多中心的横截面研究

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 社区获得的尿路感染 (CA-UTIs) 是一个重要的公共卫生问题.
• 了解尿病原体的流行率和遗传特征对于有效治疗至关重要.

研究的目的:

• 确定导致印度CA-UTIs的泌尿病原体的流行率和基因组特征.
• 在这些病原体中表征抗微生物耐药性 (AMR) 和毒性基因.

主要方法:

• 印度的多中心跨截面社区研究.
• 尿病原体的鉴定和抗微生物敏感性测试.
• 全基因组测序 (WGS) 用于基因组表征,包括AMR和病毒性基因,以及序列类型 (ST).

主要成果:

• 在11.8%的样本中检测到显著的细菌性尿;大肠杆菌 (63%) 和肺炎菌 (15.7%) 主要存在.
• 在大肠杆菌和K. pneumoniae中,扩展谱β-乳糖酶 (ESBL) 生产,多药性耐药性 (MDR) 和卡巴胺耐药性的高患病率.
• 基因组分析确定了高风险克隆 (例如,大肠杆菌ST131,ST1193;K.肺炎ST15,ST16,ST231) 携带关键的AMR基因,如blaCTX-M-15,blaNDM-5.

结论:

• 在印度社区环境中广泛存在耐药,高风险的泌尿病原体克隆.
• 迫切需要采用多方面的方法,包括常规AMR监测和明智的抗生素选择.
• 工作组确定了与耐药性相关的特定基因系和等离子体,如大肠杆菌中的ST131和ST1193.