基因组学物种划分揭示了Amanita jacksonii的血统演变的不同速度和方式
Santiago Sánchez-Ramírez1, Rodham E Tulloss2, Simona Margaritescu3
1Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Toronto, Toronto, Ontario, Canada; Department of Natural History, Royal Ontario Museum, Toronto, Ontario, Canada.
遗传学分析揭示了Amanita jacksonii综合体内的七种不同的物种,挑战了以前的分类. 这项研究澄清了真菌物种界限和北美ectomycorrhizal真菌的多样化.
科学领域:
- 菌群学 菌群学 菌群学是指菌群学
- 进化生物学 进化生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 在Amanita jacksonii s.l.的物种划界. 由于缺乏足够的形态和分子数据,这很困难.
- 传统的方法未能为这一组形成的真菌提供明确的分类学分辨率.
研究的目的:
- 在Amanita jacksonii复合体内使用族系学方法解决物种界限.
- 为了研究北美这些菌的多样化模式和进化历史.
主要方法:
- 来自63个标本的100多个遗传位点的外显子向测序.
- 分析了30342个高质量的变体和172个位点 (平均2.5Kb).
- 应用种群结构和基于凝聚的物种划分方法,以及分子约会.
主要成果:
- 强有力的基因组证据支持该综合体内有七种不同的物种.
- 在中美洲高地观察到明显的地理人口结构,但在美国低地森林中没有.
- 分子约会表明多样化始于普略纪,大多数物种发生在200万年窗口内.
- 相似的低地物种表现出比Allopatric高地种类更深的遗传分歧.
结论:
- 遗传学成功地解决了在形态上相似的真菌中的物种界限.
- 证实Amanita jacksonii s.s.仅限于阿巴拉契亚地区和加拿大东部.
- 多样化模式表明,在相应的低地物种中,潜在的前菌障碍和A. jacksonii s.s.的冰川后扩张可能存在.
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